Monosakkaritler sindirimde bir değişikliğe uğramadan emilirlerken disakkaritler ince bağırsaklarda disakkaridaz enzimleri ile monosakkaritlere dönüştürülürler. Nişastanın sindirini ağızda başalr ve tükrük bezlerince sentezlenen pityalinle başlar. Nişasta ve glikojen pityalinle dekstrine dönüşür.ince bağırsaklardan salgılanan amilaz ile nişasta oligosakkarit ve diskkaritlere kadar parçalanır. Bundan sonra disakkaritler devreye girerek monosakkaritleri açığa çıkarır. Nişasta olmayan oligosakkaritlerin ancak a-glukan yapısında olanlar sindirilebilir.

Monosakkaritlere dönüşen karbonhidratlar incebağırsaklardan emilir. Monosakkaritler fosfatlanarak aktivite kazanırlar. Glikoz fosfat früktoz fostata dönüşerek parçalanır. Parçalanma sonunda gliserolaldehit ve dihidroksiaseton fosfat oluşur. bUnlar farlı iki yoldan pirüvik asite dönüşür. Pirüvik asit asetil-CoA ya dönüşürken pantotenik asit ve tiamin yardımcı enzimleri görev yapar. Asetil CoA soksalik asitle birleşip sitrik asidi oluşturur ve kreps döngüsüne katılır. Kreps döngüsünde bir dizi reaksiyonla CO_2, H₂O ve ATP oluşur.